中国加入WTO，医药产品的关税将降低至与其他WTO缔约国相等的水平，即在百分之五点五到六点五之间。这对不再享受公费医疗待遇正愁看不起病的人们来说，无疑是一个利好：他们可以得到廉价而有效的进口药品。然而对于不在少数的中国医药企业而言，这可能是一个利空，甚至是灭顶之灾。
医药企业数量多、规模小，经济效益欠佳
截至1998年底，中国药品生产企业已达6391家，其中合资企业1790家，医药企业工业总产值达1630亿元，全行业的资金利税率已由1991年的20.38%下降为目前的5.52%。
国外的情况是，1997年世界最大的20家制药企业销售收人为1500亿美元，约占世界药品销售总额的50%左右。全球第一大制药企业美国默克公司1998年的销售额为136.47亿美元，净利润达46亿美元。而中国最大的制药企业华北制药1998年工业总产值仅为4.2亿美元。
在中国6000多家医药生产企业中，绝大多数是重复建设的中小型企业。仅诺氟沙星制剂一个产品，全国就有828家企业生产，有的省竟有75家。数量众多、规模偏小的医药企业造成了无序竞争的局面，医药企业的国际竞争力十分有限。
医药企业的科研开发能力薄弱
医药是资本、技术密集型产业，对新产品开发能力的要求很高。研究开发能力是衡量医药企业竞争力的重要因素。中国医药企业生产的药品大部分是仿制药品，并且产品结构升级缓慢，与国际医药企业相比差距非常大。
中国新药开发中，真正体现创新水平的一类新药数量从1985年至1998年的13年间，总共只有62个，平均每年不足5个。医药企业新产品开发能力低下，一方面是创新意识薄弱，另一方面是受资金短缺的制约。在国际上，创制一种新药约需15年时间，需投资2亿美元以上，而中国用于新药开发的资金每年总共只有10亿元左右。
“入世”给中国医药全业带来冲击
“人世”后，中国医药企业将会受到严峻的挑战，中国的医药产品在价格、质量、品种上与国际水平相比有明显的差距，加人WTO后关税税率的降低将直接冲击中国药品市场，制药企业将不同程度地面临国外制药企业的竞争。
而更为严峻的是，中国能生产的1350种原料药中，有97%的化学药品均是仿制品种。目前还没有一个中国药品在国外获得专利。仅有三种药品在美国获得FDA认可。国际上每年出现的新药化学实体约有40个，但属于中国的仅有2个。加强知识产权保护是WTO的重要原则，实施WTO对知识产权的保护政策后，中国许多长期依靠仿制为主的医药企业将难为以继。
可以预料，今后中国医药行业的兼并重组将出现前所未有的高潮。中国医药企业两极分化将日趋明显，一批巨型的、有竞争力的集团公司将成为中国医药业的龙头，而一大批小的、没有竞争力的企业将退出制药行业。
