生物芯片可通过分子杂交或免疫反应，通过生物芯片上固定的探针或样品生物与游离的样品生物或探针杂交来推断未知的靶分子，并对这些发生反应与否的信息采用各种标记技术进行标记，产生生物体信号。对这些生物体信号进行采集，自动收集到计算机中进行分析、处理，实现生物信息的大规模检测。如图4所示。

　　生物芯片主要指通过平面微细加工技术在固体芯片表面构建的微流体分析单元和系统，以实现对细胞、蛋白质、核酸以及其它生物组分的准确、快速、大信息量的检测。

       2.3 生物芯片分类

　　生物芯片包括DNA芯片、蛋白芯片及芯片实验室三大领域。

　　2.3.1 DNA芯片( DNACHIP )

　　作为生物芯片的一种，DNA芯片有许多同义词，如基因芯片( Genechip )、DNA微集芯片( DNA microchip )，DNA阵列(DNA array)、DNA微集阵列(DNA microarray)；此外由于DNA是一种寡核苷酸，所以也称为寡核苷酸阵列或芯片(Oligonucleotide array)。其基本原理是基因探针与特异寡聚核苷酸的碱基互补，它综合应用了生物学、化学以及工程技术科学等学科的众多相关技术。这一技术由美国Affymetrix 公司率先研制出来。
DNA芯片是生物芯片中最基础、研究开发最早、最为成熟和目前应用最广泛的产品。与传统测序技术相比，它的突出优点是整个检测过程快速高效。由于探针阵列具有高度的序列多样性,它可以同时对大量基因、乃至整个基因组进行扫描分析，从而能够使人们从一个更高的层次来全面研究基因的功能，分析不同基因之间的生物相关性。